2013年国庆假期期间（10月1日至10月7日），地铁4号线及大兴线的客运量共计1118.4万人次。其中，4号线客运量达931.7万人次，日均133.1万人次；大兴线客运量达186.7万人次，日均26.7万人次。14号线西段客运量达49.6万人次，日均7.1万人次。假期七天，京港地铁所管辖线路共计开行7441列车，其中4号线及大兴线按照节日及双休时刻表组织行车，共开行列车4837列次；14号线西段按照双休时刻组织行车，兑现率为100%，正点率为100%，客运组织总体平稳有序。
针对节日期间客流较大的情况，为进一步保证乘客安全有序乘车，京港地铁密切关注客流变化，加大了对客流的监测与分析。尤其在运力安排上，采用节日运行图及双休日运行图相结合的方式，合理充分的安排运力，同时安排备车保证乘客顺畅出行。1－7日共加开84列临时客车，其中4号线及大兴线加开14列，14号线西段加开70列，有效缓解了客运压力。同时，京港地铁继续做好 14 号线延长运营时间的各项保障工作。
国庆长假期间外出旅游乘客较多，客流高峰集中出现在国庆长假前一天9月30日及10月2日，4号线及大兴线的客运量分别达到147.5万人次、32.5万人次和153.1万人次、30.2万人次。假期期间，4号线及大兴线进出站量前三名的车站分别为：北京南站、北宫门站和动物园站；换乘量前三名的车站为西直门站海淀黄庄站以及宣武门站。14号线西段客流高峰出现在10月2日，当日客运量达到9.1万人次，进出站量最大的车站为园博园站。
由于受外埠乘客来京旅游以及北京乘客出京的影响，4号线北京南站换乘客流有明显增长，国庆假期期间该站日均进出站客流量比平日增长50%，达到22.3万人次。为了减少乘客排队，加快进站速度，车站提前购买部分车票，并根据实际需求在东西两侧增加临时单程票售票窗口。同时，工作人员及时观察乘客购票情况，随时进行硬币补充，保证乘客顺利购票。车站密切关注客流变化，增加人员配备，安排专人在站厅、站台、电扶梯、自动售票机、闸机等设备前对乘客进行协助与引导。
在西单站、北宫门站、园博园站等重点车站，站内均加派工作人员加强站内客流组织工作，加大重点部位如进站口、站台等处的客流疏导力度；同时，各换乘站加强了对重点部位如换乘通道、楼梯等处的监控，及时对客流进行疏导，避免乘客在换乘通道内及楼梯处拥堵。除了增加车站工作人员外，各车站还通过站内广播、乘客信息显示系统（PIS）等手段，及时向乘客传达客运信息，保证车站客流组织顺畅。
与往年国庆假期不同，地铁4号线动物园站今年并没有硬性的全天封站，而是根据每日客流的情况采取动态限流及临时封站的措施。今后，这也将成为京港地铁所辖线路的常态措施。京港地铁公司应用了全面的综合数据管理系统，为4号线各车站都设置了客流警戒线，以动物园站为例，一旦上午出站客流连续两个小时内，每半小时均超过5000人，车站将即刻预警，准备在乘客下午返程高峰时段实行限流措施。国庆假期期间，为保障乘客出行安全，京港地铁运用这套系统数据进行客流分析预测，并结合安保预警系统，实现动态限流和临时封站，不用硬性全天封站。
同时，节日期间，京港地铁车辆部门及维修保障部门加强对车辆及相关设备的维护，确保设备及列车运行的安全、可靠、稳定。按照“逢包必检，逢液必查，逢疑必问”的原则，“国庆”长假期间，共查出违禁品572件，确保了乘客的出行安全。